За отсутствие транспортной накладной (в том числе электронной) для случаев, когда оформлять ее обязательно, на водителя налагают административный штраф в размере 500 руб. (п. 2 ст. 12.3 КоАП РФ).
Штрафов непосредственно за несоблюдение электронной формы транспортной накладной сейчас нет. Однако с того момента, когда оформлять электронную транспортную накладную станет обязательно, для заказчика, учитывающего транспортные расходы, отсутствие такого документа влечет риск отказа в признании налоговым органом этих расходов в целях налога на прибыль, а также вычета НДС по ним и, как следствие, доначисление налогов, штрафов и пеней на основании Налогового кодекса РФ. Это следует из п. 1 ст. 172, п. 1 ст. 252 НК РФ.